一、巢湖（居巢）分公司：下轄巢湖汽車(chē)站（包括柘皋等鄉鎮分代站）、巢湖巢宇大眾汽車(chē)出租有限責任公司、巢湖汽車(chē)租賃分公司、巢湖交通旅行社。

二、無(wú)為分公司：下轄無(wú)為汽車(chē)站（包括鄉鎮分代站）、無(wú)為汽車(chē)南站、無(wú)為城市公交公司、無(wú)為城鄉公交公司、無(wú)為至誠公交分公司、無(wú)為汽車(chē)租賃分公司、無(wú)為縣盛友汽車(chē)出租有限責任公司、無(wú)為縣通達出租汽車(chē)有限責任公司、無(wú)為汽車(chē)修理廠(chǎng)等單位。

三、安徽飛雁廬江客運有限公司：下轄廬江汽車(chē)站（包括鄉鎮分代站）、廬江長(cháng)途汽車(chē)站、客運一公司、客運二公司、廬江城市公交公司、廬江城鄉客運公司、廬江汽車(chē)修理廠(chǎng)等單位。

四、和縣分公司：下轄和縣汽車(chē)站（包括鄉鎮分代站）、和縣宏運汽車(chē)出租有限公司、和縣汽車(chē)修理廠(chǎng)。

五、含山分公司：下轄含山汽車(chē)站（包括鄉鎮分代站）、含山汽車(chē)修理廠(chǎng)。

六、無(wú)為縣運輸公司

七、巢湖運眾汽車(chē)銷(xiāo)售服務(wù)有限公司

八、安徽交運集團巢湖汽運有限公司駕駛員培訓學(xué)校

九、巢湖市經(jīng)緯城鄉客運有限公司：主營(yíng)巢湖市校車(chē)客運。

十、廬江星夢(mèng)校車(chē)服務(wù)有限公司：主營(yíng)廬江縣校車(chē)客運。

十一、巢湖城鄉公交分公司：主營(yíng)巢湖市城鄉公交客運，下轄巢湖公交南站等站點(diǎn)。

十二、廣告、物業(yè)、易達分公司

十三、巢湖客車(chē)修理廠(chǎng)

十四、廬江分公司

十五、和縣飛雁城鄉客運有限公司

十六、合肥分公司